במקביל לכך, משרד הבריאות יקדם דיונים מול כל הגורמים הרלוונטיים לעבודת המכון – הפרקליטות, המשטרה, הסנגוריה הציבורית, צה"ל ועוד – להסדרת פעילות המכון בחקיקה, תוך הסדרת קשרי הגומלין מול אותם גופים, הן בשגרה והן בחירום.