הכשל המרכזי שמעלה דוח המבקר הוא היעדר ניהול ממשלתי. היעדרות נציג מתאים ממשרד ראש הממשלה, ממשרד התפוצות וממזכירות הממשלה, מהווה פגיעה במשילות בנגב, זלזול בכנסת והודאה בכישלון בהשגת יעד מרכזי שהציגה הממשלה לעצמה.